112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1380 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  84.55 
 
 
758 aa  1287    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  77.65 
 
 
764 aa  1172    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  81.31 
 
 
762 aa  1258    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  81.18 
 
 
762 aa  1232    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  81.83 
 
 
762 aa  1237    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  54.36 
 
 
755 aa  797    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  77.39 
 
 
761 aa  1170    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  45.59 
 
 
764 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  100 
 
 
765 aa  1568    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  77.12 
 
 
761 aa  1166    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  46.6 
 
 
766 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  77.65 
 
 
764 aa  1173    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  45.06 
 
 
770 aa  588  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.41 
 
 
639 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  25.29 
 
 
639 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  24.52 
 
 
789 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.13 
 
 
789 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.78 
 
 
788 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.32 
 
 
639 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  26.34 
 
 
646 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.45 
 
 
639 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.27 
 
 
639 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.13 
 
 
656 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.3 
 
 
639 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.19 
 
 
639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  23.14 
 
 
788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.84 
 
 
639 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.36 
 
 
885 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.56 
 
 
778 aa  108  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.74 
 
 
639 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.22 
 
 
782 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 
667 aa  105  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  25.04 
 
 
639 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24.29 
 
 
741 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  22.87 
 
 
653 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.24 
 
 
742 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.52 
 
 
742 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.02 
 
 
820 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.98 
 
 
826 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.76 
 
 
742 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 
650 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  21.94 
 
 
895 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 
656 aa  91.3  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  32.29 
 
 
898 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  32.29 
 
 
898 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.71 
 
 
663 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.57 
 
 
898 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.47 
 
 
640 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  23.03 
 
 
809 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.34 
 
 
716 aa  87.4  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.03 
 
 
671 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.25 
 
 
720 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  27.06 
 
 
650 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  26.92 
 
 
650 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.92 
 
 
745 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  26.44 
 
 
650 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  24.94 
 
 
893 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.68 
 
 
650 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.2 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  29.43 
 
 
822 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.19 
 
 
727 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.25 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.68 
 
 
936 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  23.42 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.18 
 
 
671 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.89 
 
 
722 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  32.33 
 
 
843 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  22.92 
 
 
729 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.73 
 
 
719 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  24.75 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.59 
 
 
657 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.92 
 
 
754 aa  64.3  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  22.84 
 
 
730 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.26 
 
 
730 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.37 
 
 
735 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  30.34 
 
 
833 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.38 
 
 
724 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  23.14 
 
 
730 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  22.57 
 
 
725 aa  60.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.27 
 
 
945 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  23.59 
 
 
741 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  41.67 
 
 
700 aa  58.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  40 
 
 
642 aa  58.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  33 
 
 
677 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  31.82 
 
 
612 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.18 
 
 
762 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  28.94 
 
 
696 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  25.95 
 
 
731 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 
729 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  24.03 
 
 
785 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  22.56 
 
 
724 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  32 
 
 
680 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  65.12 
 
 
545 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  61.36 
 
 
696 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  39 
 
 
687 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  28.11 
 
 
757 aa  51.6  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.84 
 
 
714 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  64.71 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01691  putative serine rich repeat containing protein  46.15 
 
 
692 aa  50.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  34.34 
 
 
698 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>