More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1347 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  100 
 
 
278 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.00998e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  95.31 
 
 
278 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  95.31 
 
 
278 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  94.95 
 
 
278 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  93.98 
 
 
268 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.85139e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  93.98 
 
 
268 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  94.74 
 
 
265 aa  523  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  93.98 
 
 
268 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.20153e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  93.98 
 
 
268 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.68537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  87.97 
 
 
265 aa  493  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  87.59 
 
 
265 aa  491  1e-138  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.06904e-06  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  88.35 
 
 
266 aa  491  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.18116e-06  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  87.22 
 
 
265 aa  491  1e-138  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 
265 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.94672e-07  hitchhiker  1.44576e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  86.14 
 
 
266 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 
265 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  68.71 
 
 
280 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.90489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  68.8 
 
 
262 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  67.15 
 
 
275 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03238  methionine aminopeptidase  60.55 
 
 
292 aa  362  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002745  methionine aminopeptidase  60.21 
 
 
292 aa  361  7e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0499689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  60.07 
 
 
264 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  61.94 
 
 
262 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  62.73 
 
 
263 aa  329  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  63.1 
 
 
264 aa  328  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.90504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
263 aa  324  8e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.77508e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
263 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  58.58 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  56.72 
 
 
264 aa  322  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  63.36 
 
 
270 aa  319  2e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  63.36 
 
 
258 aa  319  3e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  58.21 
 
 
264 aa  318  4e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
264 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
264 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  61.36 
 
 
260 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 
258 aa  315  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  61.74 
 
 
261 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  55.22 
 
 
264 aa  314  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  62.12 
 
 
260 aa  313  1e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  61.74 
 
 
261 aa  313  2e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  59.62 
 
 
261 aa  313  2e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  59.77 
 
 
258 aa  311  7e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
261 aa  311  7e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  56.34 
 
 
264 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  60 
 
 
254 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  60 
 
 
254 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  59.54 
 
 
256 aa  308  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 
264 aa  307  1e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  60.77 
 
 
260 aa  303  3e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
260 aa  302  3e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  61.15 
 
 
260 aa  302  3e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
260 aa  301  6e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
260 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  58.11 
 
 
260 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
260 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  57.74 
 
 
263 aa  298  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  56.98 
 
 
260 aa  297  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  58.17 
 
 
255 aa  295  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  57.59 
 
 
259 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  57.2 
 
 
259 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
267 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.85 
 
 
258 aa  291  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  56.98 
 
 
266 aa  291  9e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.17 
 
 
258 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  56.98 
 
 
266 aa  290  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  54.02 
 
 
267 aa  288  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 
274 aa  283  2e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  55.94 
 
 
266 aa  283  3e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  53.28 
 
 
264 aa  282  5e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  54.95 
 
 
267 aa  282  5e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  7.31877e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  53.28 
 
 
264 aa  281  6e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 
269 aa  281  6e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
284 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  55.86 
 
 
255 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  56.32 
 
 
266 aa  278  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  55.25 
 
 
256 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  54.33 
 
 
262 aa  277  1e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  53.08 
 
 
266 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  57.37 
 
 
285 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  53.64 
 
 
267 aa  275  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  54.26 
 
 
269 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  54.26 
 
 
269 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  54.37 
 
 
270 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  54.79 
 
 
271 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  54.79 
 
 
271 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  54.62 
 
 
253 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  54.79 
 
 
271 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  54.79 
 
 
271 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>