255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1106 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  287  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.29477e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  91.84 
 
 
147 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  91.84 
 
 
147 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.73209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  91.84 
 
 
147 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.61495e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  91.84 
 
 
147 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.66717e-06  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  94.56 
 
 
147 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  87.07 
 
 
147 aa  246  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.01727e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  81.63 
 
 
147 aa  243  7e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.25752e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  83.67 
 
 
147 aa  242  2e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  237  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  80.27 
 
 
147 aa  236  6e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.6102e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  82.31 
 
 
147 aa  236  6e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.87831e-05  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  94.56 
 
 
147 aa  233  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.60635e-08  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  232  1e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  93.88 
 
 
147 aa  231  4e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.80626e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  93.2 
 
 
147 aa  228  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.46062e-09  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  64.38 
 
 
147 aa  193  5e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.15544e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  63.7 
 
 
147 aa  190  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  62.33 
 
 
147 aa  181  2e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.24068e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  60.96 
 
 
147 aa  182  2e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.37941e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  58.22 
 
 
147 aa  182  2e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  60.99 
 
 
151 aa  178  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  59.18 
 
 
149 aa  171  3e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  61.9 
 
 
148 aa  161  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  6.22771e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  57.04 
 
 
150 aa  160  5e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.71328e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  55.48 
 
 
148 aa  159  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  55.48 
 
 
148 aa  159  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  56.03 
 
 
152 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  54.93 
 
 
156 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  56.16 
 
 
147 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  54.79 
 
 
148 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  52.74 
 
 
149 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  56.43 
 
 
152 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  56.85 
 
 
148 aa  149  9e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  54.11 
 
 
148 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  58.9 
 
 
148 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 
150 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  55.8 
 
 
149 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  53.1 
 
 
151 aa  146  1e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  52.05 
 
 
149 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  144  4e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  143  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  52.05 
 
 
148 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  53.42 
 
 
152 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  52.74 
 
 
149 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  51.72 
 
 
149 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  49.32 
 
 
147 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  57.53 
 
 
148 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  53.19 
 
 
149 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  51.03 
 
 
149 aa  140  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  52.74 
 
 
152 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 
148 aa  140  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  44.44 
 
 
149 aa  139  1e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.30099e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  139  1e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.20895e-09 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  59.59 
 
 
147 aa  138  2e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  55.48 
 
 
148 aa  137  4e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  54.79 
 
 
148 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  48.94 
 
 
149 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  52.05 
 
 
148 aa  136  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  48.94 
 
 
149 aa  136  8e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  45.58 
 
 
148 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  52.74 
 
 
148 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  53.42 
 
 
148 aa  133  7e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  133  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  46.58 
 
 
148 aa  132  2e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  46.36 
 
 
153 aa  132  2e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  53.42 
 
 
148 aa  132  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  46.58 
 
 
148 aa  132  2e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  53.42 
 
 
148 aa  132  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  43.45 
 
 
148 aa  131  4e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  52.74 
 
 
148 aa  129  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 
148 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  129  1e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  45.58 
 
 
149 aa  129  1e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  43.54 
 
 
149 aa  129  1e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  7.04345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  48 
 
 
151 aa  129  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  54.11 
 
 
148 aa  129  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  50.68 
 
 
148 aa  128  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  129  2e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  45.89 
 
 
148 aa  127  5e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  49.32 
 
 
148 aa  126  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  45.14 
 
 
146 aa  125  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
149 aa  124  4e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  45.11 
 
 
150 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 
148 aa  123  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  45.03 
 
 
153 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.06 
 
 
146 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  39.46 
 
 
151 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  48.97 
 
 
150 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.23444e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  47.68 
 
 
153 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>