More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1083 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.22 
 
 
505 aa  639  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.17 
 
 
508 aa  662  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.94 
 
 
502 aa  674  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.71 
 
 
508 aa  660  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.42 
 
 
505 aa  636  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.6 
 
 
511 aa  638  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
540 aa  656  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
508 aa  656  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  98.79 
 
 
496 aa  1011  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
508 aa  655  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
508 aa  656  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.94 
 
 
507 aa  647  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.37 
 
 
497 aa  637  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.35425e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
540 aa  656  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
508 aa  656  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  87.9 
 
 
496 aa  915  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.24 
 
 
507 aa  670  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.12 
 
 
499 aa  658  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  98.59 
 
 
496 aa  1008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  89.11 
 
 
496 aa  916  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  88.91 
 
 
496 aa  912  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.07 
 
 
497 aa  642  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.17 
 
 
499 aa  875  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 
499 aa  654  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.04 
 
 
507 aa  665  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  60.36 
 
 
497 aa  635  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.35 
 
 
512 aa  643  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.05 
 
 
499 aa  662  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.55 
 
 
512 aa  644  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  89.31 
 
 
496 aa  917  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.94 
 
 
507 aa  647  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.67 
 
 
496 aa  872  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.62 
 
 
503 aa  635  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 
499 aa  660  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
508 aa  656  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.92 
 
 
499 aa  654  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.34 
 
 
506 aa  709  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.56 
 
 
497 aa  635  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.57228e-09  decreased coverage  1.67809e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.36 
 
 
497 aa  634  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.83 
 
 
501 aa  875  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  99.19 
 
 
496 aa  1014  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.27 
 
 
496 aa  877  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.48 
 
 
508 aa  676  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.37 
 
 
497 aa  644  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.29 
 
 
508 aa  674  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.56 
 
 
497 aa  634  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.49078e-07  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  62.35 
 
 
499 aa  647  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.22 
 
 
505 aa  642  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1334  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.02 
 
 
503 aa  645  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.79 
 
 
509 aa  659  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1022  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.48294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3003  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.21 
 
 
503 aa  649  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.27 
 
 
496 aa  873  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.56277e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 
504 aa  649  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.57 
 
 
497 aa  644  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.56 
 
 
497 aa  634  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  98.39 
 
 
496 aa  1005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.29 
 
 
508 aa  674  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
509 aa  649  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 
498 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.08 
 
 
498 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.56 
 
 
497 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  2.43063e-07  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.83 
 
 
506 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4104  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.83 
 
 
505 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 
505 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 
499 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3456  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.63 
 
 
505 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.04 
 
 
498 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.51 
 
 
506 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.84 
 
 
512 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.52 
 
 
502 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0372  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.81 
 
 
501 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.92 
 
 
499 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0780531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4293  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.61 
 
 
505 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74921  normal  0.50186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.73 
 
 
503 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.03 
 
 
498 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
498 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.03 
 
 
498 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
507 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.07 
 
 
496 aa  618  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3730  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.4 
 
 
505 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.4 
 
 
501 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.99732e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0098  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.54 
 
 
498 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  58.3 
 
 
535 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.78 
 
 
497 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.03 
 
 
498 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3203  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 
505 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
496 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.6 
 
 
506 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.91 
 
 
506 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 
505 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0414  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  58.84 
 
 
498 aa  614  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5671  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.01 
 
 
505 aa  611  1e-174  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1697  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.2 
 
 
505 aa  614  1e-174  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4052  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 
523 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.93 
 
 
500 aa  614  1e-174  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4438  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
518 aa  612  1e-174  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68099  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4314  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 
505 aa  612  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389944  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.84 
 
 
510 aa  613  1e-174  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>