267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0984 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 160 aa  336  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  88.12 
 
 		 160 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  86.88 
 
 		 160 aa  299  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  86.88 
 
 		 160 aa  298  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  86.88 
 
 		 160 aa  298  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  86.88 
 
 		 160 aa  297  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  86.88 
 
 		 160 aa  296  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  86.25 
 
 		 160 aa  296  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  83.12 
 
 		 160 aa  288  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  78.75 
 
 		 160 aa  270  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  77.5 
 
 		 160 aa  266  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  73.75 
 
 		 160 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  76.25 
 
 		 160 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  72.5 
 
 		 160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  72.5 
 
 		 160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  73.75 
 
 		 160 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  59.74 
 
 		 173 aa  188  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  57.5 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  64.23 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  56.55 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  53.79 
 
 		 176 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  55.86 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.91 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  54.55 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  55.22 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  51.3 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 183 aa  163  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  54.93 
 
 		 170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  48.52 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  54.61 
 
 		 170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  54.29 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  50.36 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  57.97 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  50.69 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 171 aa  156  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  53.19 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  54.81 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 171 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  54.81 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.57 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  55.07 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 196 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 196 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  54.29 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 196 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  51.8 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  55 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  48.92 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  41.4 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.48 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  46.72 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>