111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0982 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  96.05 
 
 
253 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  96.05 
 
 
253 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  95.65 
 
 
253 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  95.26 
 
 
253 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  94.47 
 
 
253 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  94.47 
 
 
253 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  94.47 
 
 
253 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  94.07 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  83.4 
 
 
253 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  82.54 
 
 
252 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  84.19 
 
 
253 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  82.54 
 
 
252 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  85.38 
 
 
253 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  84.19 
 
 
253 aa  427  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  77.87 
 
 
253 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  52.03 
 
 
258 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  50.6 
 
 
259 aa  259  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  49.4 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  49.61 
 
 
258 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  48.82 
 
 
277 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  48.96 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  48.82 
 
 
277 aa  244  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  48.82 
 
 
256 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  48.82 
 
 
256 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  48.82 
 
 
256 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  48.82 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  48.43 
 
 
274 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  48.43 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  50.6 
 
 
266 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  47.79 
 
 
289 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  48.43 
 
 
274 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  48.19 
 
 
314 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  48.19 
 
 
303 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  47.79 
 
 
314 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  47.79 
 
 
314 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  47.79 
 
 
314 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  49.8 
 
 
266 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  49.8 
 
 
266 aa  234  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  49.4 
 
 
266 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  47.62 
 
 
273 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  46.99 
 
 
260 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  47.62 
 
 
279 aa  222  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  45.38 
 
 
258 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  45.71 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  44.92 
 
 
239 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  39.29 
 
 
268 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  40.24 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  39.04 
 
 
267 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  31.18 
 
 
258 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  29.51 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  36.43 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  31.01 
 
 
420 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  25.79 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  26.4 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  27.8 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  28.91 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  26.42 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  26.36 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  26.56 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  23.77 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  24.86 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  24.86 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  30.16 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  28.63 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.36 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  28.74 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  29.15 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  25.32 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  27.73 
 
 
433 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  24 
 
 
451 aa  59.7  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  25.51 
 
 
511 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  26.77 
 
 
422 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.75 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  24.65 
 
 
468 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  25.94 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  20.63 
 
 
529 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.65 
 
 
529 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  21.63 
 
 
250 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  22.76 
 
 
455 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.23 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.96 
 
 
415 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.72 
 
 
410 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  22.71 
 
 
458 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  21.26 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  20.4 
 
 
531 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  20.4 
 
 
531 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  20 
 
 
531 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  28.36 
 
 
573 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  25.56 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  25.56 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  21.54 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.17 
 
 
461 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  20.97 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.05 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  23.11 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  22 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>