More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0960 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  86.36 
 
 
288 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  85.61 
 
 
288 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  84.47 
 
 
290 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  84.47 
 
 
288 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  79.77 
 
 
272 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  77.43 
 
 
272 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  64.71 
 
 
268 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  63.64 
 
 
254 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  57.94 
 
 
254 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  50.62 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  48.8 
 
 
259 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  49.38 
 
 
260 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  48.29 
 
 
260 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 
255 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 
255 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 
255 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 
255 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
255 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  45.37 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  43.48 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  42.56 
 
 
258 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  43.6 
 
 
261 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 
265 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.96 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.3 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.4 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.96 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  43.29 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.14 
 
 
256 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.75 
 
 
268 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
271 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
293 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.58 
 
 
259 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
271 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  40.44 
 
 
258 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
266 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  38.1 
 
 
265 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.92 
 
 
274 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.34 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  35.29 
 
 
269 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  36.8 
 
 
261 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.96 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.51 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 
260 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 
270 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.33 
 
 
273 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  36.43 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  38.6 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  39.33 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  38.25 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  35.18 
 
 
292 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  40.17 
 
 
257 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  40.17 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  34.12 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.09 
 
 
277 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.08 
 
 
253 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  39.32 
 
 
269 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
273 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 
264 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 
264 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.95 
 
 
269 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  36.72 
 
 
265 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  36.23 
 
 
269 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>