178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0891 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
241 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  87.97 
 
 
241 aa  451  1e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  87.97 
 
 
241 aa  451  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  87.97 
 
 
241 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  87.97 
 
 
241 aa  451  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  89.21 
 
 
241 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  89.21 
 
 
241 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  88.38 
 
 
241 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  87.97 
 
 
241 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  71.9 
 
 
245 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  70.29 
 
 
251 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  69.04 
 
 
242 aa  360  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  70.54 
 
 
241 aa  357  1e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.22 
 
 
241 aa  352  3e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.15 
 
 
242 aa  348  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.86403e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  64.58 
 
 
242 aa  326  2e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.66 
 
 
240 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.83 
 
 
261 aa  238  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.15 
 
 
236 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.72 
 
 
236 aa  225  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.72 
 
 
236 aa  225  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  48.72 
 
 
236 aa  225  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.29 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.72 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.36 
 
 
237 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  48.29 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  48.29 
 
 
236 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.86 
 
 
236 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.01 
 
 
237 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.44 
 
 
238 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.62 
 
 
238 aa  216  3e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.1 
 
 
238 aa  215  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.54 
 
 
251 aa  215  6e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.2 
 
 
238 aa  213  2e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.98 
 
 
238 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.98 
 
 
238 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.98 
 
 
238 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.26 
 
 
239 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.98 
 
 
264 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  42.36 
 
 
258 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  45 
 
 
272 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  41.07 
 
 
245 aa  188  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  41.13 
 
 
232 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.64 
 
 
262 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  42.86 
 
 
244 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  44.2 
 
 
241 aa  178  6e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.77 
 
 
250 aa  177  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.6 
 
 
210 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  43.72 
 
 
246 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.24 
 
 
246 aa  174  1e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  38.91 
 
 
244 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  37.72 
 
 
262 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  43.92 
 
 
238 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.98401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  43.65 
 
 
263 aa  166  3e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  41.27 
 
 
262 aa  166  3e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.42 
 
 
247 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.92 
 
 
245 aa  164  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41 
 
 
260 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  43.63 
 
 
243 aa  164  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41 
 
 
247 aa  163  2e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.33 
 
 
241 aa  163  2e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  42.41 
 
 
265 aa  161  8e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.51 
 
 
253 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.09 
 
 
242 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.58 
 
 
242 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.56 
 
 
245 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.24 
 
 
264 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.65 
 
 
242 aa  154  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  36.97 
 
 
237 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  39.04 
 
 
254 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.33 
 
 
255 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  33.62 
 
 
285 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  35 
 
 
277 aa  119  4e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  42.06 
 
 
285 aa  108  7e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  35.9 
 
 
179 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  32.2 
 
 
237 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.04 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  30.04 
 
 
236 aa  99  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  35.29 
 
 
178 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  31.46 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  32.59 
 
 
241 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.79 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  33.18 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  32.73 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.18 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  27.11 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.3 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  31.08 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  28.69 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.35 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  28.17 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  31.05 
 
 
248 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  31.05 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.46 
 
 
237 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  27.36 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  35.25 
 
 
187 aa  86.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>