35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0842 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  89.68 
 
 
281 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  88.97 
 
 
281 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  88.97 
 
 
281 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  89.96 
 
 
279 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  72.76 
 
 
289 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3064  MltA-interacting MipA family protein  72.52 
 
 
286 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0555  MltA-interacting MipA  67.94 
 
 
286 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  29.47 
 
 
285 aa  108  8e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  1.85576e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  24.15 
 
 
318 aa  65.9  7e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  23.6 
 
 
497 aa  50.8  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  26.29 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 
249 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  24.32 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  32.2 
 
 
280 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  25.14 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  28.92 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  30.12 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  2.15759e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  30.23 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  28.44 
 
 
491 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  27.59 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  27.59 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.59 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.59 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  27.59 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>