More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0814 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  62.82 
 
 		 506 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  69.76 
 
 		 515 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1055    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  62.35 
 
 		 506 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  62.62 
 
 		 506 aa  646    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  62.82 
 
 		 506 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  69.31 
 
 		 519 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  31.76 
 
 		 489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  33.73 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  32.26 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  32.63 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  31.19 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  33.1 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  32.2 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  32.2 
 
 		 518 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 511 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  32.2 
 
 		 518 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  32.2 
 
 		 518 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  31.58 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  30.13 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  29.94 
 
 		 538 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  30.13 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  32.88 
 
 		 535 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  30.13 
 
 		 518 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.38 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.3 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  32.51 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.1 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.69 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.55 
 
 		 516 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 528 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  29.84 
 
 		 528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  29.4 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  29.49 
 
 		 528 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  40.55 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  40.55 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  31.67 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.55 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.79 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  32.55 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  32.55 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  32.55 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.55 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  40.23 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  28.79 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  31.49 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  30.82 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  40.73 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  28.09 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  26.81 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  26.81 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.81 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  26.81 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  35.69 
 
 		 532 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.61 
 
 		 521 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  27.2 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  36.18 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  27.42 
 
 		 533 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  29.93 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.93 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.93 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.88 
 
 		 362 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.93 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  38.15 
 
 		 794 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  37.05 
 
 		 532 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  27.7 
 
 		 501 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.75 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  37.75 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.62 
 
 		 486 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.43 
 
 		 947 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.56 
 
 		 826 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.153825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 362 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  35.14 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  38.11 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  36.99 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  28.64 
 
 		 534 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.45 
 
 		 876 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  27.98 
 
 		 546 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  37.4 
 
 		 1093 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1691  sensory box/GGDEF family protein  36.51 
 
 		 838 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000833802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.98 
 
 		 929 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  27.63 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.06 
 
 		 631 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  39.92 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3630  sensory box/GGDEF family protein  36.19 
 
 		 828 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.931883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  32.47 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  32.47 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  32.47 
 
 		 532 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  28.4 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>