More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0810 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  72.87 
 
 		 588 aa  917    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  100 
 
 		 589 aa  1223    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  48.98 
 
 		 596 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 596 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  48.81 
 
 		 596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  50.09 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  48.81 
 
 		 596 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  49.83 
 
 		 598 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 596 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 596 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  48.81 
 
 		 597 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  48.81 
 
 		 593 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 596 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 596 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  50.26 
 
 		 589 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  48.48 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  47.32 
 
 		 591 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  44.73 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  44.22 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  43.46 
 
 		 596 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  44.21 
 
 		 596 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  44.21 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  46.56 
 
 		 589 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  46.04 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  45.1 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.9 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  42.98 
 
 		 925 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  42.57 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  41.61 
 
 		 957 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  41.95 
 
 		 925 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.88 
 
 		 608 aa  331  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 926 aa  323  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  39.62 
 
 		 504 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.11 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.55 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  38.74 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  40.87 
 
 		 609 aa  296  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  38.13 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  37.2 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.56 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.32 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.11 
 
 		 582 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  36.56 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  36.56 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.32 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  36.93 
 
 		 591 aa  257  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.33 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.93 
 
 		 515 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  35.06 
 
 		 668 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.4 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.65 
 
 		 650 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  31.87 
 
 		 637 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 483 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  35.35 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  32.75 
 
 		 627 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  34.87 
 
 		 605 aa  227  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  33.76 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.84 
 
 		 519 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  30.85 
 
 		 519 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  33.26 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  35.76 
 
 		 603 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  32.97 
 
 		 635 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 521 aa  222  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.14 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.33 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 616 aa  219  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.57 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  34.09 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.57 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  32.18 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  32.78 
 
 		 517 aa  211  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  32 
 
 		 587 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  32 
 
 		 587 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.21 
 
 		 515 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.32 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.12 
 
 		 478 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.7 
 
 		 1005 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.43 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.06 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.75 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  30.56 
 
 		 659 aa  186  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  29.49 
 
 		 1004 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.43 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  30.74 
 
 		 519 aa  180  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  30.06 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.88 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  36.58 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.1 
 
 		 552 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.8 
 
 		 506 aa  173  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.81 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.58 
 
 		 546 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.51 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.91 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  29.09 
 
 		 501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>