60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0786 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  87.23 
 
 
428 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  95.63 
 
 
424 aa  765    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  95.62 
 
 
424 aa  762    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  76.08 
 
 
425 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  95.87 
 
 
424 aa  764    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  95.39 
 
 
424 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  100 
 
 
424 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  86.42 
 
 
428 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  86.89 
 
 
428 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  77.97 
 
 
421 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  72.71 
 
 
424 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  78.04 
 
 
382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  72.73 
 
 
422 aa  564  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  49.4 
 
 
421 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  49.76 
 
 
421 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  47.51 
 
 
433 aa  342  5.999999999999999e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  43.99 
 
 
420 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  43.64 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  43.64 
 
 
428 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  44.23 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  45.91 
 
 
422 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.1 
 
 
423 aa  280  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  41.79 
 
 
421 aa  279  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.98 
 
 
452 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  39.09 
 
 
434 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  38.19 
 
 
437 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  38.19 
 
 
437 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  38.42 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  38.88 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  38.21 
 
 
434 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  37.65 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.47 
 
 
421 aa  249  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  39.1 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  38.48 
 
 
431 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  37.35 
 
 
433 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  35.65 
 
 
427 aa  226  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  37.38 
 
 
460 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  35.85 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.75 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  25.59 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  69.23 
 
 
52 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  24.65 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  22.71 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  27.56 
 
 
427 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  90.32 
 
 
48 aa  60.1  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  27.1 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  25.81 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.86 
 
 
468 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  22.25 
 
 
440 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  24.07 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  29.14 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.23 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  33.33 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  33.33 
 
 
428 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  32.53 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  30.38 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  30.38 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  30.38 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>