92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0781 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  100 
 
 		 353 aa  704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  69.38 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  69.25 
 
 		 353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  67.02 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  66.67 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  67.4 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  67.4 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  65.18 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  65.58 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  64.35 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  64.48 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  65.3 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  64.17 
 
 		 344 aa  427  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  61.34 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  57.62 
 
 		 342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  58.47 
 
 		 347 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  55.77 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  55.19 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  52.66 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  54.92 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  52.66 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  53.01 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  54.64 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  54.64 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  53.55 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  51.91 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  51.37 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  52.19 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  50.95 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  49.3 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  45.95 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  35.97 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  34.78 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  36.83 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  35.68 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  35.34 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  34.58 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  29.08 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  30.42 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  28.78 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  28.86 
 
 		 317 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  28.61 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.73 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  27.73 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  27.43 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  27.43 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  27.62 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  28.1 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  27.54 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  27.92 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.87 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  29.06 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.19 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  25.48 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  31.56 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  26.65 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  27.7 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  27.17 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  27.41 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  26.41 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  25.07 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  25.13 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  24.41 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.33 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  26.02 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  22.53 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  24.27 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  33.33 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  30.83 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  23.99 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  25.61 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  27.67 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  30.94 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  29.84 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  25.54 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  25.69 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  29.48 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  28.82 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  28.82 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  25.08 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  27.04 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  24.76 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  23.71 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  33.91 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  29.69 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  23.7 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  28.17 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>