29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0767 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  8.36076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  90.04 
 
 
245 aa  438  1e-122  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.62567e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  89.61 
 
 
245 aa  437  1e-122  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.86351e-08  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  90.91 
 
 
231 aa  438  1e-122  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.5789e-07  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  90.04 
 
 
245 aa  438  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.10891e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  91.34 
 
 
231 aa  439  1e-122  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.95933e-08  hitchhiker  1.10881e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.15651e-10  hitchhiker  6.3684e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  90.48 
 
 
231 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.04845e-05  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  69.26 
 
 
245 aa  357  1e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.9199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  67.25 
 
 
244 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  64.14 
 
 
249 aa  320  9e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  61.51 
 
 
254 aa  313  1e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  7.96342e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  63.71 
 
 
252 aa  312  3e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.18066e-06  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  59.31 
 
 
247 aa  289  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  60.27 
 
 
246 aa  275  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  38.82 
 
 
251 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  33.9 
 
 
252 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  29.05 
 
 
256 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  74.3  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.86 
 
 
250 aa  67.8  1e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  23.53 
 
 
221 aa  61.6  1e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  29.1 
 
 
209 aa  58.5  8e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  22.32 
 
 
219 aa  56.2  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  22.69 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  26.98 
 
 
199 aa  54.3  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.90926e-05  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  25.76 
 
 
232 aa  48.9  7e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  25.51 
 
 
221 aa  48.5  9e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>