More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0700 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0667  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3709  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0700  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000383643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0671  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0644  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3568  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00627875  decreased coverage  0.00976024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3398  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249246  decreased coverage  0.000697268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0554  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.109062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0703  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0421  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  181  2e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.18204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3125  co-chaperonin GroES  96.84 
 
 
96 aa  181  4e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0218784  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3661  co-chaperonin GroES  94.79 
 
 
96 aa  176  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.31471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0471  co-chaperonin GroES  92.63 
 
 
96 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.695304  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4309  co-chaperonin GroES  90.53 
 
 
96 aa  172  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0641  co-chaperonin GroES  89.47 
 
 
96 aa  171  2e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.409973  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3690  co-chaperonin GroES  88.54 
 
 
96 aa  170  7e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4671  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4697  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4383  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03974  hypothetical protein  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04012  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3870  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.819569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3850  chaperonin Cpn10  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5658  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4611  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.325354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0508  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0981396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0727  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
97 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.816729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
96 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0329  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  157  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.30664e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4726  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4747  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.604032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4607  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4599  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4690  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3530  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
97 aa  156  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.437614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3676  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3404  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
97 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3823  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0723  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
97 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
96 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  82.11 
 
 
96 aa  154  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0467  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
96 aa  154  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.30489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
96 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2238  co-chaperonin GroES  80 
 
 
96 aa  154  5e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0408  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
97 aa  154  5e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2494  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  80 
 
 
96 aa  151  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0174114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  80 
 
 
96 aa  150  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0592  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
97 aa  145  2e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0018  10 kDa chaperonin 1  78.95 
 
 
95 aa  143  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2159  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 
96 aa  125  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0415  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.21093e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000723  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  61.05 
 
 
96 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  116  8e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  7.05596e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  57.89 
 
 
96 aa  116  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.00777e-10  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
95 aa  115  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  60 
 
 
96 aa  113  7e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  113  1e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  112  2e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
97 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
97 aa  111  4e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
97 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  56.84 
 
 
97 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
97 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
97 aa  110  7e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  110  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
97 aa  109  1e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
97 aa  109  1e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  109  1e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
97 aa  109  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  109  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  1.27335e-12  n/a   
 
 
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  107  4e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
96 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
105 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
97 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  53.68 
 
 
105 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  53.68 
 
 
105 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.23216e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.65316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
105 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
96 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.86758e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
127 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.13463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
96 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.27096e-08  unclonable  2.92135e-11 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.16071e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
96 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
105 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
105 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 
105 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 
105 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
96 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 
105 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
105 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 
105 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 
105 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>