More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0649 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  94.8 
 
 		 442 aa  840    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.02 
 
 		 442 aa  841    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.93 
 
 		 445 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  90.5 
 
 		 442 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.43 
 
 		 441 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.02 
 
 		 442 aa  842    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  68.25 
 
 		 441 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  901    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.84 
 
 		 441 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.7 
 
 		 442 aa  804    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.8 
 
 		 442 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.72 
 
 		 442 aa  805    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  90.95 
 
 		 442 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  73.76 
 
 		 445 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.3 
 
 		 444 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  35.94 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  35.63 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 439 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 439 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  34.12 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  35.46 
 
 		 440 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  32.78 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  33.11 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  34.95 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 459 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  29.93 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.43 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  29.49 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.63 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  29.23 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  29.49 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  30.49 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  29.73 
 
 		 444 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 484 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  34.82 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  34.72 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  30.61 
 
 		 482 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  29.4 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  33.21 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  29.87 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  32.54 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  28.42 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  27.58 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  28.42 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  32.83 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  32.83 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  32.83 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>