89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0634 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  89.81 
 
 		 324 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  89.81 
 
 		 324 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  89.75 
 
 		 324 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89.51 
 
 		 324 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  85.45 
 
 		 349 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  86.42 
 
 		 329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  85.8 
 
 		 329 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  85.8 
 
 		 329 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  71.7 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  66.03 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  67.3 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  62.96 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  50.32 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  33.22 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  31.89 
 
 		 312 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  31.7 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  32.36 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  30.64 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  30.64 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  32.89 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  30.64 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  32.47 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  30.87 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  32.89 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  32.68 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  32.79 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  31.91 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  32.57 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  31.03 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  31.44 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  30.43 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  31.1 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  31.1 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  31.1 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  31.1 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  30.1 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  30.1 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.44 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.74 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  23.92 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.74 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  23.92 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.16 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  23.92 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.16 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.2 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  30.27 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  24.54 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  24.86 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.16 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  32.11 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.16 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.49 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  31.19 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.49 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  22.96 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.84 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  22.73 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  24.81 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  24.35 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  31.19 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.73 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28.31 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.17 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0076  integral membrane protein  27.48 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  26.32 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.81 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.81 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.26 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.73 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.53 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.42 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>