145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0610 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  84.24 
 
 		 225 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  84.65 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  83.66 
 
 		 220 aa  343  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  83.17 
 
 		 220 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  73.13 
 
 		 265 aa  313  9e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  75.76 
 
 		 208 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  75.76 
 
 		 208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  75.76 
 
 		 208 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 196 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  45.96 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  44.56 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  33.15 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 		 180 aa  94.7  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  30.46 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.42 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.76 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.12 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  29.35 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  22.67 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.26 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  22.03 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.93 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  23.93 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.93 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  21.66 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.34 
 
 		 358 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  21.47 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 		 452 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 		 844 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  25.97 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.87 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  20.9 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  25.3 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.28 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  25.87 
 
 		 343 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  24.08 
 
 		 846 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 		 370 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  23.29 
 
 		 881 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 		 976 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  22.09 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 		 866 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  22.96 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 862 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 		 825 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  20.66 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2824  hypothetical protein  21.62 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  22.63 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  24.14 
 
 		 872 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3926  pentapeptide repeat protein  23.81 
 
 		 430 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  23.12 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 949 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  22.84 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  20.92 
 
 		 452 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  21.65 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  18.18 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3961  pentapeptide repeat-containing protein  22.86 
 
 		 333 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0697467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5571  hypothetical protein  23.81 
 
 		 430 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.422571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  20.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4621  pentapeptide repeat-containing protein  22.86 
 
 		 430 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  20.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>