More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0583 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 324 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  94.44 
 
 		 324 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  94.14 
 
 		 324 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  94.14 
 
 		 324 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  93.83 
 
 		 324 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  92.9 
 
 		 324 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  92.9 
 
 		 324 aa  591  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  92.28 
 
 		 324 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  92.59 
 
 		 324 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  83.18 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  73.46 
 
 		 329 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  78.82 
 
 		 323 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  80.37 
 
 		 323 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  78.5 
 
 		 323 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  73.44 
 
 		 322 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  57.78 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  58.04 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  55.7 
 
 		 326 aa  354  8.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  58.23 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  56.05 
 
 		 332 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  53.11 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  53.42 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  41.23 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 326 aa  242  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  46.38 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  41.25 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  45.83 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  37.85 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  35.65 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  35.65 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  31.27 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  31.73 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.55 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.94 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  27.96 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.7 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.31 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.22 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  26.06 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.16 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  26.52 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  27.57 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  30.5 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  26.03 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.97 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.03 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.47 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.49 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  25.58 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.86 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  24.22 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  23.43 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.3 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  30.38 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  30.2 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  30.38 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  30.38 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.36 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  24.36 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  25.17 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  24.18 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  26.14 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  24.36 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>