More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0568 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  84.62 
 
 		 169 aa  283  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  46.96 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  47.54 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  45.35 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  41.99 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  46.86 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  42.22 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  47.83 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  45.91 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  45.88 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  42.44 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  43.02 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  41.58 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  45.7 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  44.23 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  40.45 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.42 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  44.3 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  38.54 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.01 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  72.73 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  43.8 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  39.05 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  39.05 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  39.05 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  71.21 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  37.5 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  35 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  43.33 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  65.62 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  64.62 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  39.87 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.96 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  41.53 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  57.75 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  61.43 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  61.43 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  61.43 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  61.43 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0177  prepilin-type cleavage/methylation  38.34 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  35.33 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  36.18 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  32.3 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  31.61 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  36.09 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  53.95 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  52.78 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  53.95 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  35.37 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  32.77 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  38.26 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  61.9 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  60.61 
 
 		 108 aa  72  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  61.02 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  54.69 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  34.5 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  33.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  65.52 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  33.95 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  33.92 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  45.88 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  63.33 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  63.64 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  41.76 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  59.32 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  59.32 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  59.32 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  60.34 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  60.34 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  60.34 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  60.34 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  70 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  37.76 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  65.31 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  64 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  42.65 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  38.05 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  34.1 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  56.9 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  38.66 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  58.62 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  55 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  46.48 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  44.78 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  44.78 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  61.11 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  44.78 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  45.83 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  44.78 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  61.7 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  44.78 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  44.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  44.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  51.52 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  50.91 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>