38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0545 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  307  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54909e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  89.74 
 
 
156 aa  282  1e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  89.74 
 
 
156 aa  282  1e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  89.74 
 
 
156 aa  282  1e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.60855e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  89.61 
 
 
154 aa  281  3e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  80.77 
 
 
156 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.06621e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  80.77 
 
 
156 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.58021e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  80.77 
 
 
156 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.83526e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  80.77 
 
 
156 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  77.78 
 
 
153 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  75.5 
 
 
153 aa  240  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  75.33 
 
 
159 aa  236  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  74.15 
 
 
155 aa  233  5e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  78.38 
 
 
157 aa  233  5e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  6.52394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  70.51 
 
 
159 aa  230  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  65.79 
 
 
153 aa  221  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.66 
 
 
149 aa  52  3e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.08 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  29.53 
 
 
144 aa  49.3  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  32 
 
 
143 aa  49.7  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.38 
 
 
153 aa  48.1  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.25 
 
 
151 aa  48.1  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.34 
 
 
147 aa  47.8  6e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.8 
 
 
154 aa  47.8  7e-05  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  31.51 
 
 
143 aa  47.4  7e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.66 
 
 
140 aa  47.4  8e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.66 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  29.66 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.95 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  23.38 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  23.38 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  25.53 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  27.56 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  31.13 
 
 
464 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  28.19 
 
 
462 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  27.4 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  24.83 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>