More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0421 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 406 aa  832    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  72.66 
 
 		 406 aa  627  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  38.38 
 
 		 855 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.26 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.18 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.35 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  30.17 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  32.26 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  29.51 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.96 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  33.15 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  28.99 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  27.32 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  35.16 
 
 		 772 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  32.43 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  26.8 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  32 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  29.84 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  34.25 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  31.84 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.21 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.49 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  27.52 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  33.33 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.92 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  26.72 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  32.97 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  31.08 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  26.84 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.07 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.64 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  31.29 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  30.05 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 589 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  32.87 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  29.19 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  33.33 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  29.19 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  30.05 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  27.84 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.57 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  27.59 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  30.39 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  33.78 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.26 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.28 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  34.67 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  26.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0970  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  34.67 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  29.5 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  26.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  30.59 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  29.24 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3418  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.59 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.11 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  25 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  26.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  27.55 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.67 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  26.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.78 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  28.9 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  26.15 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.77 
 
 		 457 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  29.81 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.77 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.57 
 
 		 569 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.65 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.38 
 
 		 473 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  29.84 
 
 		 535 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  28.49 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  28.14 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0611  serine protease, putative  28.99 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.413309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  28.48 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  27.65 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  34.03 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  28.99 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  26.97 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  33.76 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  27.23 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  26.18 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  29.35 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  29.03 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  27.81 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.32 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>