54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0373 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  78.92 
 
 
168 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  78.31 
 
 
168 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  78.31 
 
 
168 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  77.11 
 
 
168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  77.91 
 
 
177 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  80.37 
 
 
177 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  76.4 
 
 
177 aa  247  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  79.75 
 
 
177 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  44.89 
 
 
178 aa  174  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  54.49 
 
 
174 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  46.07 
 
 
178 aa  163  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  45.78 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  43.5 
 
 
182 aa  151  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  47.13 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  44.05 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  32.39 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  32.4 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  29.35 
 
 
193 aa  87  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  27.93 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  32.05 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  30.34 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  29.87 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  25.67 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  26.42 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  27.93 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  32.12 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  31.97 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  26.14 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  32.45 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  26.14 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  23.95 
 
 
203 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  26.97 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  27.89 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  25.66 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  27.08 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  27.86 
 
 
210 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  30.36 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  28.66 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  31.65 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  30.32 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  27.56 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  26.38 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  30.84 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  24.2 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  38.33 
 
 
147 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  47.83 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  45.65 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  41.79 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  45.65 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  27.13 
 
 
151 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  38.18 
 
 
298 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>