110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0329 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  100 
 
 
212 aa  447  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  77.62 
 
 
223 aa  351  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  77.14 
 
 
216 aa  350  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  76.19 
 
 
217 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  75.24 
 
 
213 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  74.29 
 
 
212 aa  335  3e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  74.76 
 
 
212 aa  330  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  76.19 
 
 
212 aa  330  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  74.29 
 
 
212 aa  325  4e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  56.67 
 
 
211 aa  261  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  56.67 
 
 
211 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  56.67 
 
 
211 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  55.45 
 
 
214 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  51.43 
 
 
211 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  54.81 
 
 
213 aa  227  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.76 
 
 
212 aa  219  2e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  50.96 
 
 
215 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  50 
 
 
222 aa  215  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  45.97 
 
 
212 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  46.19 
 
 
212 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  45.97 
 
 
215 aa  198  4e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  45.89 
 
 
225 aa  194  8e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  45.97 
 
 
214 aa  194  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  41.83 
 
 
230 aa  188  6e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  42.11 
 
 
257 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  45.67 
 
 
215 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  45.97 
 
 
233 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  40.87 
 
 
223 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
222 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
217 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  37.67 
 
 
217 aa  162  5e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  35.81 
 
 
222 aa  130  1e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  127  8e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  127  1e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.15 
 
 
214 aa  126  2e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  35.05 
 
 
212 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.49 
 
 
220 aa  124  8e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  34.11 
 
 
212 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  34.42 
 
 
222 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  29.86 
 
 
226 aa  118  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  35.71 
 
 
214 aa  117  1e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  31.78 
 
 
212 aa  113  2e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  113  2e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  31.78 
 
 
212 aa  113  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  31.78 
 
 
212 aa  113  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  32.56 
 
 
232 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.02 
 
 
220 aa  109  4e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.03 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  28.5 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.29 
 
 
672 aa  58.2  8e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
310 aa  55.1  8e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
263 aa  53.1  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.21 
 
 
274 aa  53.1  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
222 aa  53.1  3e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.39 
 
 
345 aa  53.1  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.94 
 
 
300 aa  52.4  6e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24.4 
 
 
287 aa  51.6  9e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
273 aa  50.8  1e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
323 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
323 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
286 aa  50.4  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 
275 aa  50.1  3e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
333 aa  49.7  4e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
2490 aa  49.3  4e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
324 aa  49.3  4e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.09 
 
 
291 aa  49.7  4e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  26.35 
 
 
240 aa  49.3  4e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 
310 aa  49.3  5e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
1177 aa  48.5  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
248 aa  48.5  8e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  8.22833e-10 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
271 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.98 
 
 
323 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.37 
 
 
303 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
282 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
1177 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  30.53 
 
 
358 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
332 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  29.75 
 
 
304 aa  45.1  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
293 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
306 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  21.68 
 
 
574 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.34 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  25.52 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
1046 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
361 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.85 
 
 
415 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.95 
 
 
346 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25 
 
 
336 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862077  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.34 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  3.01378e-06 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
265 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>