More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0168 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  100 
 
 
550 aa  1134    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  68.4 
 
 
479 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  75.85 
 
 
479 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  72.99 
 
 
552 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  78.4 
 
 
551 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  55.46 
 
 
562 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  54.93 
 
 
547 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  54.74 
 
 
547 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  55.69 
 
 
561 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  55.52 
 
 
561 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  55.69 
 
 
561 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  55.14 
 
 
561 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  55.14 
 
 
561 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  54.96 
 
 
561 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  55.14 
 
 
561 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  54.96 
 
 
561 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  55.14 
 
 
561 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  56.93 
 
 
541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  54.38 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  54.42 
 
 
564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  54.8 
 
 
561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  54.04 
 
 
565 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  54.24 
 
 
564 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  53.38 
 
 
561 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  54.48 
 
 
562 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  57.24 
 
 
467 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  52.76 
 
 
560 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  57.02 
 
 
503 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  55.43 
 
 
468 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  54.58 
 
 
468 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  39.96 
 
 
546 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.96 
 
 
546 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  38.34 
 
 
546 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  44.23 
 
 
767 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  38.6 
 
 
546 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  42.36 
 
 
479 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  43.82 
 
 
745 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  42.06 
 
 
767 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  38.7 
 
 
548 aa  349  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  38.2 
 
 
550 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.05 
 
 
473 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  43.01 
 
 
457 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  41.03 
 
 
475 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  41.85 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  39.36 
 
 
468 aa  316  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.43 
 
 
468 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  39.35 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.59 
 
 
468 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  39.96 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  39.74 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  39.45 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  39.69 
 
 
476 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  39.69 
 
 
476 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  39.69 
 
 
476 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  37.9 
 
 
557 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  41.26 
 
 
478 aa  296  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  37.63 
 
 
480 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  40.56 
 
 
467 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.53 
 
 
469 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.79 
 
 
469 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  38.75 
 
 
464 aa  286  7e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.2 
 
 
453 aa  286  8e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  39.5 
 
 
476 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  37.53 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  37.06 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  36.29 
 
 
448 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.69 
 
 
471 aa  254  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.78 
 
 
485 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.92 
 
 
471 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  35.59 
 
 
458 aa  246  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.81 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  35.28 
 
 
484 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  32.73 
 
 
484 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.28 
 
 
717 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.21 
 
 
456 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  32.65 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  31.75 
 
 
464 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  31.52 
 
 
464 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.62 
 
 
475 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  34.81 
 
 
466 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  34.79 
 
 
466 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  32.1 
 
 
515 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  29.46 
 
 
468 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 
458 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
484 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  34.07 
 
 
464 aa  223  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
484 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.18 
 
 
704 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.08 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  31.64 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.98 
 
 
712 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  32.83 
 
 
464 aa  221  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.67 
 
 
452 aa  220  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.51 
 
 
448 aa  220  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 
458 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  32.86 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.19 
 
 
717 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 
468 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30.7 
 
 
460 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.74 
 
 
722 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>