22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0155 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  100 
 
 		 544 aa  1123    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  32.95 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  32.09 
 
 		 518 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  25 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  25.66 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  25.24 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  23.44 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  27.32 
 
 		 549 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  24.39 
 
 		 586 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  23.49 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  23.98 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  31.85 
 
 		 284 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  39.66 
 
 		 663 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 556 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  24.57 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  27.87 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  40.82 
 
 		 630 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  35.16 
 
 		 789 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  24.31 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  38 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  36.73 
 
 		 530 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.77 
 
 		 369 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>