19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0121 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  88.67 
 
 
150 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  88 
 
 
150 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  87.33 
 
 
150 aa  276  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  88 
 
 
150 aa  276  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  83.33 
 
 
149 aa  260  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  82.67 
 
 
149 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  82 
 
 
149 aa  257  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  83.47 
 
 
121 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  73.57 
 
 
140 aa  220  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  70 
 
 
140 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  68.57 
 
 
140 aa  209  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  73.39 
 
 
140 aa  198  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  48.57 
 
 
140 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  40.58 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  38.73 
 
 
162 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  36.03 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  42.74 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  32.58 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>