More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0096 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
249 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  80.08 
 
 
251 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  80.08 
 
 
251 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  79.75 
 
 
251 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  87.25 
 
 
239 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  83.11 
 
 
239 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  81.82 
 
 
239 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  77.45 
 
 
239 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  61.34 
 
 
245 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  67.17 
 
 
326 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  61.21 
 
 
243 aa  285  3e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  69.1 
 
 
299 aa  274  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  65.33 
 
 
329 aa  273  2e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  57.63 
 
 
247 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.58 
 
 
226 aa  264  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  52.49 
 
 
237 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.02 
 
 
217 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  45.9 
 
 
297 aa  165  7e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  45.36 
 
 
297 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  50 
 
 
328 aa  162  4e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  46.52 
 
 
188 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  47.65 
 
 
304 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 
203 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  59.17 
 
 
196 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 
218 aa  148  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  45.56 
 
 
212 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.99 
 
 
208 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 
261 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  55.74 
 
 
199 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.78 
 
 
202 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  58.27 
 
 
207 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  54.31 
 
 
217 aa  141  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 
244 aa  139  5e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  53.6 
 
 
211 aa  138  9e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 
216 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  57.76 
 
 
234 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  57.6 
 
 
208 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.54 
 
 
197 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 
280 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  42.22 
 
 
221 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.54 
 
 
218 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  51.59 
 
 
233 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.24 
 
 
206 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 
206 aa  134  1e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.88 
 
 
224 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.11 
 
 
198 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.24 
 
 
222 aa  132  4e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.55 
 
 
204 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  57.39 
 
 
217 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 
204 aa  130  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
189 aa  131  1e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  52.59 
 
 
174 aa  131  1e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  51.67 
 
 
235 aa  130  2e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  56.52 
 
 
191 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  53.57 
 
 
258 aa  128  9e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 
261 aa  127  1e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  45.74 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45.74 
 
 
259 aa  127  2e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  45.74 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  50.82 
 
 
216 aa  127  2e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  45.74 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  45.74 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  46.51 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 
195 aa  127  2e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  45.74 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  46.51 
 
 
261 aa  127  2e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 
199 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  49.25 
 
 
197 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45.74 
 
 
261 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.18 
 
 
283 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 
281 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 
305 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  48.12 
 
 
146 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  45.6 
 
 
273 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.51 
 
 
214 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  40.88 
 
 
203 aa  120  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 
215 aa  119  5e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 
238 aa  119  5e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.77614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 
242 aa  117  2e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
263 aa  117  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  50.89 
 
 
228 aa  117  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  39.11 
 
 
200 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 
245 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  38.25 
 
 
230 aa  116  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 
202 aa  116  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  51.3 
 
 
201 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
438 aa  115  7e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.88 
 
 
209 aa  115  9e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  39.89 
 
 
209 aa  114  1e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  40.33 
 
 
209 aa  114  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  46.83 
 
 
241 aa  114  1e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  44.8 
 
 
251 aa  114  1e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 
291 aa  114  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 
318 aa  114  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  48.53 
 
 
285 aa  114  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 
194 aa  114  2e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.33 
 
 
209 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 
362 aa  112  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
204 aa  112  4e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
272 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>