143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0075 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  86.23 
 
 		 186 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  84.78 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  84.78 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  84.06 
 
 		 186 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  81.75 
 
 		 142 aa  233  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  82.96 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  82.22 
 
 		 142 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  34.85 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  24.43 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  30.08 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  26.85 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 326 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 		 306 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  30.43 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  24.17 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 329 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.72 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  25.84 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  26.47 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  23.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  26.72 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  31.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  22.48 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25.61 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  26.32 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  24.6 
 
 		 154 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  26.72 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.6 
 
 		 325 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 164 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  25.78 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  35.09 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  23.66 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>