15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0073 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  80.45 
 
 		 180 aa  298  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  46.24 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  41.52 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  46.36 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  34.91 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  35.23 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  31.13 
 
 		 432 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.13 
 
 		 431 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.68 
 
 		 439 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  29.9 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  29.21 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  26.53 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>