15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0054 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  85.37 
 
 		 83 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  84.15 
 
 		 83 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  80.49 
 
 		 83 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  76.83 
 
 		 81 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  68.97 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  67.82 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  43.9 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  46.34 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  44.87 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  39.56 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  40.24 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1161  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>