30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4862 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  299  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  63.38 
 
 
139 aa  184  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  72.73 
 
 
146 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  70.91 
 
 
149 aa  176  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  39.26 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  36.55 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  37.32 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  37.19 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  38.18 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  38.83 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  41.94 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  38.68 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  35.24 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  31.69 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  34.03 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  34.75 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  33.06 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  35.24 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  35.24 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  31.5 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  32.04 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  26.73 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  32.35 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>