279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4674 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  62.61 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  62.61 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  60 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  48.99 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  50.59 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.26 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  46.91 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  46.91 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  47.33 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  49.34 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  45.57 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  44.9 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  44.9 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.17 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  43.9 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  44.49 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.16 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  43.06 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.15 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  43.78 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  44.1 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  44.1 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  42.21 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  42.21 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  42.21 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  42.21 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  43.67 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  43.67 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  40.33 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  43.14 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  41.47 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  39.01 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  39.92 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  39.09 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  39.09 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  42.67 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  42.67 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  42.67 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  41.81 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  41.81 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  38.71 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.71 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.71 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  38.71 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  38.71 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  38.71 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.77 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  36.75 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  36.75 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  36.75 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  36.32 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  36.32 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  38.07 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  37.74 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  35.18 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  34.26 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.26 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  34.26 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  34.14 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  34.39 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  33.05 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.65 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.23 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  35.07 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.65 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  33.65 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  33.65 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.65 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  33.19 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  33.17 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  32.69 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.38 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.38 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.39 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  35.24 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  32.69 
 
 		 227 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  34.63 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  30.8 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.85 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.2 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  32.21 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.85 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.38 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.81 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  31.93 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  31.93 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  31.93 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.5 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  31.73 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  31.25 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  34.22 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  34.22 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  34.22 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  31.93 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  34.22 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.48 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  31.73 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  37.29 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>