More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4323 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  100 
 
 
258 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  84.5 
 
 
264 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  84.5 
 
 
264 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  84.5 
 
 
264 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  83.92 
 
 
258 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  83.07 
 
 
258 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  83.53 
 
 
258 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  83.14 
 
 
259 aa  447  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  79.84 
 
 
258 aa  430  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  77.91 
 
 
258 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  77.91 
 
 
258 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  77.91 
 
 
258 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.91 
 
 
258 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.91 
 
 
258 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.91 
 
 
258 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.91 
 
 
258 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.52 
 
 
258 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  77.91 
 
 
258 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  47.01 
 
 
268 aa  215  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  47.27 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  47.27 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  47.27 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  47.27 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.88 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.88 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.88 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.48 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.48 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.48 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.48 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.48 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  46.88 
 
 
257 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  47.41 
 
 
257 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  47.11 
 
 
244 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  43.65 
 
 
258 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 
256 aa  200  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  46.5 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  46.18 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  46.18 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  46.18 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  44.67 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  42.45 
 
 
255 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  42.28 
 
 
255 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  43.85 
 
 
255 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  45.19 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
249 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  38.26 
 
 
253 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
255 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  36.47 
 
 
249 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  36.47 
 
 
249 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  36.47 
 
 
249 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  36.47 
 
 
249 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
250 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  39.63 
 
 
245 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
265 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
257 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  32.61 
 
 
260 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  36.4 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  35.53 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 
235 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 
286 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  40.61 
 
 
252 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 
250 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  37.61 
 
 
252 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 
240 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 
246 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 
245 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  36.92 
 
 
237 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
235 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.86 
 
 
239 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  34.67 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
233 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 
240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 
240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  32.59 
 
 
247 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3660  GntR-like  35.27 
 
 
245 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  33.59 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  33.59 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  33.59 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  30.4 
 
 
231 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
251 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 
239 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  30.26 
 
 
233 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>