More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4230 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  100 
 
 		 467 aa  922    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  48.56 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  45.98 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  41.7 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  40.31 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  40.92 
 
 		 491 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  40.71 
 
 		 491 aa  328  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  40.92 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  40.92 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  40.92 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  40.92 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  40.92 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  39.52 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  40.24 
 
 		 491 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  37.06 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  37.2 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  40.52 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  38.89 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  39.06 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  37.12 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  39 
 
 		 486 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  38.86 
 
 		 464 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  36.77 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.44 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  38.14 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  37.83 
 
 		 468 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  38.33 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  36.89 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.14 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  35.78 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  39.83 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  37.9 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  37.17 
 
 		 544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  37.69 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  38.71 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  39.78 
 
 		 493 aa  269  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  37.63 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  36.52 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  37.96 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  38.65 
 
 		 469 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.56 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  37.25 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  40.26 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  37.04 
 
 		 463 aa  260  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  38.01 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  36.8 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  36.46 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  38.28 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.81 
 
 		 482 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  35.14 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  38.18 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  38.18 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  38.18 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.18 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  36.17 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  34.57 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  37.93 
 
 		 490 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.58 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.51 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.56 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  33.77 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  39.3 
 
 		 482 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  37.58 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.33 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.82 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  36.03 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35.29 
 
 		 472 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.29 
 
 		 472 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.8 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  35.08 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  35.08 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.68 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.08 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  35.35 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  37.63 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.08 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.08 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.08 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.08 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  37.66 
 
 		 474 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  33.84 
 
 		 471 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  33.7 
 
 		 477 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.55 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.29 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.29 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.29 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.29 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  35.28 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.08 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.59 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.96 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.36 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  33.05 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  36.73 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  34.75 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  32.83 
 
 		 473 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.99 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  34.24 
 
 		 496 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.01 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  33.69 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>