183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4219 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4219  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  51.01 
 
 
390 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  51.01 
 
 
390 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  50.58 
 
 
394 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  51.01 
 
 
390 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  50.58 
 
 
394 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  51.01 
 
 
390 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  51.01 
 
 
390 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  50.72 
 
 
390 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  50.72 
 
 
390 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  50.58 
 
 
394 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  50.72 
 
 
390 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  50.58 
 
 
394 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  50.58 
 
 
394 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  41.36 
 
 
392 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40.22 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  39.94 
 
 
392 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  39.48 
 
 
389 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  38.1 
 
 
385 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  37.05 
 
 
391 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  36.59 
 
 
394 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  36.95 
 
 
386 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  36.97 
 
 
392 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.97 
 
 
392 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.09 
 
 
392 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.69 
 
 
392 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.64 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.81 
 
 
392 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  36.69 
 
 
392 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  34.72 
 
 
392 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  36.09 
 
 
392 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  34.15 
 
 
383 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2730  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.46 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0988  tetraheme cytochrome c  35.39 
 
 
391 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  35.55 
 
 
389 aa  230  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  36.34 
 
 
361 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  35.28 
 
 
392 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  34.69 
 
 
364 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  35.57 
 
 
364 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.17 
 
 
411 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.460429  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  35.96 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  33.15 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  32.85 
 
 
366 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  34.1 
 
 
366 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  33.62 
 
 
366 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  32.56 
 
 
366 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  32.56 
 
 
366 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  32.56 
 
 
366 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  32.56 
 
 
366 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  32.28 
 
 
366 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  32.28 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  47.13 
 
 
200 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  46.25 
 
 
200 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.74 
 
 
234 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  47.13 
 
 
200 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05375  cytochrome c-type protein NapC  45.86 
 
 
192 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000515  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
170 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  44.65 
 
 
196 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  46.79 
 
 
202 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
200 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
200 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2364  cytochrome c-type protein NapC  44.94 
 
 
191 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
200 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
200 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  46.2 
 
 
200 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  43.29 
 
 
215 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  47.77 
 
 
191 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0086  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  46.2 
 
 
171 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  44.03 
 
 
233 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  45.16 
 
 
191 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2381  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  46.06 
 
 
195 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000554571  normal  0.329531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1938  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  46.06 
 
 
195 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00561646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1945  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  46.06 
 
 
195 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1772  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  43.9 
 
 
195 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2425  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  45.57 
 
 
199 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2678  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  44.94 
 
 
199 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.401671  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  43.59 
 
 
203 aa  143  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1624  periplasmic nitrate reductase C-type cytochrome, NapC/NirT  45 
 
 
195 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.123114  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1844  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  44.85 
 
 
195 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  hitchhiker  0.000210051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2133  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  44.85 
 
 
195 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1902  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  44.85 
 
 
195 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.526119  hitchhiker  0.000000839402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1499  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  44.24 
 
 
195 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.924736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  43.31 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1912  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  45.45 
 
 
195 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00847918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  43.31 
 
 
200 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  43.31 
 
 
199 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1905  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  44.85 
 
 
195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>