More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4191 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 844 aa  1745    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  65.44 
 
 		 846 aa  1149    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 		 886 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 881 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 		 866 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 825 aa  499  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 825 aa  499  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 825 aa  499  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 825 aa  499  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  35.74 
 
 		 862 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 		 825 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  35.86 
 
 		 825 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  36.35 
 
 		 872 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.76 
 
 		 870 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.19 
 
 		 949 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.77 
 
 		 976 aa  219  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.59 
 
 		 381 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 449 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 		 309 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.15 
 
 		 880 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 		 872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 880 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 880 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 880 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 877 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  27.57 
 
 		 880 aa  121  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.44 
 
 		 333 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31 
 
 		 576 aa  114  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 		 862 aa  114  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.87 
 
 		 340 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.73 
 
 		 264 aa  107  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 		 351 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 		 309 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 515 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 		 343 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 		 343 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.93 
 
 		 336 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.93 
 
 		 336 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.23 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.8 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 360 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 360 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 360 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 320 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.56 
 
 		 360 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.56 
 
 		 360 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.56 
 
 		 360 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 332 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 517 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  29 
 
 		 343 aa  99.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.69 
 
 		 359 aa  99  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.1 
 
 		 311 aa  98.6  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.13 
 
 		 268 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 		 262 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.01 
 
 		 440 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  24.91 
 
 		 635 aa  97.8  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 		 262 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 		 354 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.2 
 
 		 493 aa  96.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 354 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 		 358 aa  95.5  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  27.15 
 
 		 450 aa  95.1  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.67 
 
 		 370 aa  94.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28.68 
 
 		 267 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 442 aa  94.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  27.3 
 
 		 356 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  28.36 
 
 		 401 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 401 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 		 456 aa  92  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.43 
 
 		 355 aa  92  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 452 aa  92  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  24.23 
 
 		 607 aa  91.7  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 446 aa  91.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.75 
 
 		 286 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 493 aa  91.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  30.6 
 
 		 354 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  30.6 
 
 		 354 aa  91.3  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  30.6 
 
 		 354 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 		 567 aa  90.9  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  30.6 
 
 		 354 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  28.19 
 
 		 237 aa  90.9  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 489 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.21 
 
 		 319 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.6 
 
 		 295 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  28.27 
 
 		 393 aa  88.6  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1191 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  31.1 
 
 		 354 aa  87.4  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.94 
 
 		 734 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.01 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30.24 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>