More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3955 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  86 
 
 		 250 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  86 
 
 		 250 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  85.6 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  75.81 
 
 		 252 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  75.81 
 
 		 252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  74.6 
 
 		 252 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  74.6 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  74.6 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  74.6 
 
 		 252 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  74.6 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  74.6 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  73.79 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  74.19 
 
 		 252 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  77.2 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  74.6 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  77.6 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  68 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  61.11 
 
 		 253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  67.52 
 
 		 252 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  59.84 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  59.84 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  59.84 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  59.84 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  59.84 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  60.73 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  59.45 
 
 		 254 aa  318  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  62.03 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  62.45 
 
 		 235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  64.54 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  61.54 
 
 		 252 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  61.54 
 
 		 252 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  58.06 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  63.32 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  56.52 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  56.92 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  56.92 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  56.92 
 
 		 604 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  60.09 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  55.34 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  54.94 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  52.57 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  52.99 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.64 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.99 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.18 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  43.06 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  37.25 
 
 		 289 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.52 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  30.3 
 
 		 272 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.08 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  33.08 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  30.4 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  33.93 
 
 		 424 aa  92.8  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  31.22 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.72 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  27.1 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  31.37 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.24 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  29.26 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  27.06 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  29.21 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  25.3 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  30.82 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  31.05 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  28.28 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  30.24 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  33.71 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.45 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  27.07 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  27.6 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  28.64 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.22 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30.41 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>