127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3885 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 68 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  76.56 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  63.93 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  54.41 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  60.34 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  60.34 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  60.34 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1730  phage transcriptional regulator, AlpA  56.14 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.907409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  60.34 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  51.61 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  51.61 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  58.82 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  51.61 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  51.61 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  49.15 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  52.38 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  45.61 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  43.1 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  48.08 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  38.57 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  40 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  46 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  46.3 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  44.07 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  40.98 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  39.66 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  46.94 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  38.98 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  41.51 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  41.27 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  40.74 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  40 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  39.53 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  40 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  35.94 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  38.6 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  30.91 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  33.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  38.6 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2530  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4148  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260842  normal  0.601946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1051  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  25.42 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>