89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3841 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  68.6 
 
 
231 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  67.63 
 
 
231 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  68.16 
 
 
242 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  66.51 
 
 
211 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  66.51 
 
 
211 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  66.51 
 
 
211 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  62.38 
 
 
245 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  59.05 
 
 
218 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  58.1 
 
 
218 aa  256  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  57.28 
 
 
256 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  58.25 
 
 
214 aa  238  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  57.08 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  54.07 
 
 
233 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  55.83 
 
 
214 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  53.59 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  51.74 
 
 
221 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  50.97 
 
 
217 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  49.51 
 
 
217 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  51.24 
 
 
230 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  50.75 
 
 
230 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  49.03 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  50.75 
 
 
230 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  50.75 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  49.76 
 
 
233 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  36.95 
 
 
206 aa  141  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  35.75 
 
 
209 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  33.66 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  31.12 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.18 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  35.08 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  32.47 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  36.3 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  36.3 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  36.3 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  36.3 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  36.3 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  36.3 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  36.3 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  32.22 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  26.47 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  31.86 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  34.22 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  27.72 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.73 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  29.9 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  26.4 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  25.25 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.95 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  25.25 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  34.31 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  25.79 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  30.22 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.38 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  30.71 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  28.67 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  30.71 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  30 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.58 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  26.6 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  30.2 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  29.41 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  27.51 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  25.38 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  27.32 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  30.87 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  23.4 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  28.06 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  24.12 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.14 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  27.14 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  19.9 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  22.68 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  26.22 
 
 
297 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  22.95 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  23.86 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  23.15 
 
 
336 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>