98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3840 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  76.35 
 
 
295 aa  445  1e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  76.01 
 
 
295 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  76.01 
 
 
295 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  71.33 
 
 
293 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  74.17 
 
 
293 aa  417  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  64.21 
 
 
291 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  67.15 
 
 
299 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  60.47 
 
 
486 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  62.5 
 
 
444 aa  355  4e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  62.86 
 
 
404 aa  355  4e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  62.5 
 
 
395 aa  355  6e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  63.1 
 
 
404 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  63.1 
 
 
404 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  63.1 
 
 
404 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  63.1 
 
 
395 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  62.46 
 
 
291 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  60.95 
 
 
295 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  60.58 
 
 
295 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  62.41 
 
 
293 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  62.78 
 
 
293 aa  342  6e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  63.02 
 
 
296 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 
291 aa  320  2e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 
291 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  52.07 
 
 
287 aa  315  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  54.14 
 
 
317 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  56.02 
 
 
292 aa  309  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  53.38 
 
 
317 aa  308  6e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
299 aa  304  1e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
299 aa  303  2e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
299 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  50.92 
 
 
299 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 
303 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 
307 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 
307 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 
307 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 
307 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 
307 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
283 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  42.96 
 
 
292 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  44.18 
 
 
289 aa  244  1e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  45.11 
 
 
293 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  42.31 
 
 
304 aa  236  5e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
288 aa  233  4e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  44.91 
 
 
298 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
293 aa  197  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  38.35 
 
 
288 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.45 
 
 
299 aa  189  3e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 
266 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
273 aa  147  2e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  32.01 
 
 
293 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  31.88 
 
 
273 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  33.73 
 
 
292 aa  131  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  29.39 
 
 
302 aa  110  4e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  21.68 
 
 
299 aa  67.8  2e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
274 aa  60.5  4e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
301 aa  55.8  8e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 
298 aa  54.3  2e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
321 aa  53.1  6e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
249 aa  52.8  8e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
278 aa  52  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 
526 aa  51.2  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  26.94 
 
 
291 aa  50.8  3e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
332 aa  50.1  4e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.3 
 
 
287 aa  50.4  4e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.71 
 
 
319 aa  50.1  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
319 aa  49.3  7e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
597 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
336 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.39 
 
 
319 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
319 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
315 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.27 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.4 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  22.36 
 
 
591 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.91 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 
441 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3595  Beta-lactamase  20.49 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
246 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>