More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3826 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  85.23 
 
 		 238 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  84.19 
 
 		 238 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  85.71 
 
 		 238 aa  390  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  82.48 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  82.48 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  82.48 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  82.48 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  82.48 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  81.2 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  56.72 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  60 
 
 		 250 aa  279  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  59.15 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  55.7 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  57.38 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  56.6 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  61.54 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  58.12 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  53.78 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  54.85 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  53.59 
 
 		 252 aa  258  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  52.86 
 
 		 577 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  52.5 
 
 		 241 aa  257  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  57.33 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  53.78 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  51.54 
 
 		 528 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  50.21 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  52.72 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  52.72 
 
 		 518 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  52.3 
 
 		 522 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  50.66 
 
 		 529 aa  251  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  54.77 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  51.46 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  51.49 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  52.36 
 
 		 530 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  57.63 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  56.78 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  58.15 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  54.2 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  58.4 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  50.22 
 
 		 529 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.79 
 
 		 516 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48.95 
 
 		 522 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  51.53 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  56.03 
 
 		 257 aa  244  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  54.85 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  53.42 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  51.06 
 
 		 518 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  51.1 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  49.36 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  57.76 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 523 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.79 
 
 		 523 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 518 aa  242  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 523 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  49.79 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  52.92 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  55.02 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  52.42 
 
 		 518 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  57.44 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  49.78 
 
 		 271 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55.36 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 522 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  53.42 
 
 		 522 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 519 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  50 
 
 		 519 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 252 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 519 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  50 
 
 		 519 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 519 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  50.22 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  48.32 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  48.32 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  56.65 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>