More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3737 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  48.4 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  43.68 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  43.07 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  36.14 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  37.74 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 303 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  38.15 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.38 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  32.79 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.34 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.16 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  28.37 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.6 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.56 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.56 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.56 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  34.94 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.05 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.97 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  28.8 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.4 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  27.52 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  29.82 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>