162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3726 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  58 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  48.33 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  55.77 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.26 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  55.1 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  46.15 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  52.83 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  53.06 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.02 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  59.57 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  48.98 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  44.64 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  39.39 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  55.1 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  53.06 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  37.88 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  51.06 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  48 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  46.94 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  45.1 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  44 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  46.81 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  51.06 
 
 		 267 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  46.94 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38.98 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  41.82 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40.82 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  44.68 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  43.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  43.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  35.19 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  43.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  35.19 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  43.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  43.14 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  47.06 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  38.98 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  42.55 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  41.82 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  39.22 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  44 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  39.13 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  39.22 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  41.51 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  48.84 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  38.3 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  40.35 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>