More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3704 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  58.68 
 
 
242 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.02 
 
 
242 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  57.02 
 
 
242 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  59.5 
 
 
244 aa  315  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  56.2 
 
 
283 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  56.2 
 
 
252 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  56.2 
 
 
252 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  56.2 
 
 
242 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  56.15 
 
 
244 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  57.02 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  57.08 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  57.08 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  58.33 
 
 
259 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  53.31 
 
 
242 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  54.13 
 
 
257 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  43.98 
 
 
269 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
269 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  45.61 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 
246 aa  231  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  40.25 
 
 
260 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  43.93 
 
 
256 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  43.21 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 
246 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.8 
 
 
244 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  34.71 
 
 
246 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
243 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  33.19 
 
 
243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  30.54 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  30.13 
 
 
243 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
243 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  30.13 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  30.54 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  29.71 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  29.71 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  30.13 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  29.03 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.31 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.81 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  27.31 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.31 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
264 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0484  hypothetical protein  41.59 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.873682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.85 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  26.61 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.51 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.09 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.39 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.64 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.64 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  23.89 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.67 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.33 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  27.61 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  27.85 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.19 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.06 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.22 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  24.17 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>