More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3700 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  77.55 
 
 		 1049 aa  1654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  63.71 
 
 		 1037 aa  1352    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  75.12 
 
 		 1034 aa  1571    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  71.4 
 
 		 1037 aa  1492    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  71.4 
 
 		 1037 aa  1492    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  75.02 
 
 		 1034 aa  1568    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  63.71 
 
 		 1037 aa  1352    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  77.55 
 
 		 1049 aa  1654    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  62.21 
 
 		 1052 aa  1328    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  64.22 
 
 		 1050 aa  1358    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2818  multidrug efflux RND transporter MexD  50.39 
 
 		 1042 aa  984    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.35 
 
 		 1042 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  56.43 
 
 		 1049 aa  1141    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  64.02 
 
 		 1053 aa  1336    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0312  multidrug efflux system transmembrane protein  51.18 
 
 		 1049 aa  967    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712007  normal  0.0691835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  46.58 
 
 		 1052 aa  853    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  44.17 
 
 		 1037 aa  858    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  44.34 
 
 		 1051 aa  848    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  63.42 
 
 		 1044 aa  1339    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2592  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.86 
 
 		 1047 aa  991    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.886048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.13 
 
 		 1044 aa  1359    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  66.15 
 
 		 1066 aa  1380    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.66 
 
 		 1047 aa  1002    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.5 
 
 		 1048 aa  1234    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.22 
 
 		 1044 aa  1363    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  57.44 
 
 		 1075 aa  1220    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.21 
 
 		 1040 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6289  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.73 
 
 		 1076 aa  926    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.72315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.86 
 
 		 1051 aa  1196    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.51 
 
 		 1050 aa  1380    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1417  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.29 
 
 		 1054 aa  1348    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.93 
 
 		 1053 aa  1000    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0254632  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.83 
 
 		 1057 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  66.25 
 
 		 1066 aa  1384    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2058  multidrug efflux protein  51.45 
 
 		 1043 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.92 
 
 		 1054 aa  1343    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.18 
 
 		 1043 aa  967    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.04 
 
 		 1032 aa  1090    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3318  cation efflux transporter  57.28 
 
 		 1039 aa  1142    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0288  acridine efflux pump  60.7 
 
 		 1053 aa  1274    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  64.86 
 
 		 1063 aa  1343    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6824  hydrophobe/amphiphile efflux pump  50.49 
 
 		 1047 aa  966    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78636  normal  0.200306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4768  multidrug efflux protein  52.42 
 
 		 1045 aa  1051    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157004  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4995  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  46.18 
 
 		 1053 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  65.67 
 
 		 1066 aa  1368    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  62.76 
 
 		 1047 aa  1299    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.12 
 
 		 1053 aa  1334    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.6 
 
 		 1049 aa  1223    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.93 
 
 		 1057 aa  861    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.84 
 
 		 1052 aa  973    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.83 
 
 		 1050 aa  1338    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  66.05 
 
 		 1066 aa  1378    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2444  multidrug efflux protein  51.75 
 
 		 1043 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.43 
 
 		 1055 aa  1309    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.48 
 
 		 1048 aa  1290    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.58 
 
 		 1053 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.56 
 
 		 1044 aa  1131    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2065  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.5 
 
 		 1052 aa  1072    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1871  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  61.61 
 
 		 1046 aa  1249    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2729  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.34 
 
 		 1036 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0409192  normal  0.0822346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.57 
 
 		 1047 aa  844    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1360  multidrug efflux protein  51.4 
 
 		 1037 aa  1016    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.21 
 
 		 1059 aa  1096    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  65.12 
 
 		 1069 aa  1388    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1743  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  47.95 
 
 		 1084 aa  955    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134866  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2985  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  47.23 
 
 		 1068 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.13 
 
 		 1046 aa  1311    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.12 
 
 		 1049 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0839162  normal  0.444783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.52 
 
 		 1042 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3780  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.52 
 
 		 1054 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0221065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.59 
 
 		 1056 aa  1016    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1758  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.54 
 
 		 1100 aa  1214    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.04251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1121  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.88 
 
 		 1044 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.66 
 
 		 1050 aa  1211    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  64.76 
 
 		 1048 aa  1355    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.65 
 
 		 1054 aa  1001    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1143  multidrug efflux protein  52.32 
 
 		 1046 aa  1030    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.829538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.67 
 
 		 1066 aa  1374    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4471  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.9 
 
 		 1047 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.43 
 
 		 1065 aa  1184    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.77 
 
 		 1063 aa  1326    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6372  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.67 
 
 		 1059 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3799  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.22 
 
 		 1053 aa  1061    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.09 
 
 		 1044 aa  1353    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.09 
 
 		 1044 aa  1353    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.13 
 
 		 1051 aa  1322    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1521  multidrug efflux protein  53.1 
 
 		 1045 aa  1048    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.76 
 
 		 1066 aa  1370    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  65.96 
 
 		 1046 aa  1409    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  51.45 
 
 		 1045 aa  1058    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  49.9 
 
 		 1043 aa  983    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1623  multidrug efflux protein  52.32 
 
 		 1046 aa  1030    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1706  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.67 
 
 		 1059 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.67 
 
 		 1066 aa  1374    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.9 
 
 		 1047 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.52 
 
 		 1065 aa  1185    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.77 
 
 		 1063 aa  1326    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3679  acriflavin resistance protein  58.16 
 
 		 1057 aa  1188    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.441622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.07 
 
 		 1052 aa  844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  60.54 
 
 		 1041 aa  1279    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>