33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3695 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.54497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  48.99 
 
 
222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  48.48 
 
 
222 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  46.31 
 
 
223 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  46.31 
 
 
222 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  46.31 
 
 
222 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  46.31 
 
 
222 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  46.31 
 
 
222 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  46.31 
 
 
222 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  37.38 
 
 
223 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  34.48 
 
 
225 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  34.33 
 
 
223 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  34.54 
 
 
225 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  37.69 
 
 
223 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  34.02 
 
 
225 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  34.02 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  33.81 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  33.18 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  28.71 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  28.23 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  25.49 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  25.7 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  23.11 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  24.42 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  24.66 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  24.88 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>