252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3635 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  47.01 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  50.37 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  48.36 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  47.41 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  45.19 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  45.19 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  45.86 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  46.27 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.57 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  45.52 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  45.26 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  44.19 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  44.03 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  39.85 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  45.53 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  44.96 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  42.03 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  44.96 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  41.84 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  42.4 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  44.7 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  41.84 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  39.55 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.76 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  42.75 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  42.5 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  42.37 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  39.85 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 388 aa  97.4  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  40 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  37.23 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  40 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  39.71 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  45.04 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  39.5 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  36.03 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 301 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  39.53 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  42.61 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  38.76 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  45.71 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  38.3 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  37.01 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  41.46 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  36.09 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  37.59 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  34.81 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  37.82 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>