More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3542 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  78.19 
 
 
513 aa  828    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  82.16 
 
 
511 aa  872    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  81.57 
 
 
511 aa  865    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  100 
 
 
516 aa  1060    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  81.1 
 
 
509 aa  865    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  76.42 
 
 
513 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  75.83 
 
 
513 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  88.37 
 
 
519 aa  944    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  76.42 
 
 
526 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  76.42 
 
 
526 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  88.57 
 
 
519 aa  946    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  76.03 
 
 
513 aa  793    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  80.67 
 
 
509 aa  855    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  88.57 
 
 
519 aa  946    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  76.42 
 
 
526 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  76.23 
 
 
513 aa  795    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  76.42 
 
 
526 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  53 
 
 
500 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  53.88 
 
 
501 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  53.05 
 
 
501 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  53.29 
 
 
501 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  51.45 
 
 
516 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  50.3 
 
 
520 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  44.78 
 
 
509 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  43.61 
 
 
508 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  43.18 
 
 
500 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  43.03 
 
 
500 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.18 
 
 
501 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  42.04 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.87 
 
 
498 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.87 
 
 
498 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  41.16 
 
 
503 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.87 
 
 
498 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  43.15 
 
 
497 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.34 
 
 
506 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  41.45 
 
 
500 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.51 
 
 
526 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  41.63 
 
 
500 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 
500 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  44.53 
 
 
506 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  42.98 
 
 
508 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.84 
 
 
500 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  42.98 
 
 
508 aa  362  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  41.91 
 
 
500 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  41.48 
 
 
501 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  41.68 
 
 
505 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  44 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  42.6 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.77 
 
 
498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.28 
 
 
498 aa  356  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.07 
 
 
498 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  38.97 
 
 
503 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  43.74 
 
 
499 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.52 
 
 
497 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  43.2 
 
 
499 aa  353  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.26 
 
 
498 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  42.27 
 
 
499 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  44.69 
 
 
505 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.98 
 
 
497 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.86 
 
 
500 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  41.46 
 
 
508 aa  342  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  41.44 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  39.53 
 
 
520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  44.96 
 
 
517 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  42.42 
 
 
509 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.75 
 
 
494 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  40.73 
 
 
491 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
504 aa  334  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
504 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39.55 
 
 
494 aa  333  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  333  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  333  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
504 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  39.52 
 
 
494 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.52 
 
 
494 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.52 
 
 
494 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  39.52 
 
 
494 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
518 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  43.84 
 
 
507 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  38.48 
 
 
535 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  37.88 
 
 
504 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  37.88 
 
 
504 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  37.88 
 
 
504 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.07 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.34 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.87 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  37.62 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.87 
 
 
493 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.33 
 
 
510 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.87 
 
 
493 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.87 
 
 
493 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 
520 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 
520 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>