246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3500 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  253  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  72.81 
 
 
132 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  68.29 
 
 
125 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  67.48 
 
 
125 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  66.67 
 
 
118 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  66.67 
 
 
118 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  66.67 
 
 
118 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  65.81 
 
 
118 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  65.52 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  58.47 
 
 
127 aa  159  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  64.1 
 
 
118 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  64.1 
 
 
118 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  157  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  60.17 
 
 
120 aa  157  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  63.25 
 
 
118 aa  155  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  63.25 
 
 
118 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  62.28 
 
 
115 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  55.36 
 
 
112 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  56.9 
 
 
115 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  56.64 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  52.99 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  53.51 
 
 
121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  53.51 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  52.59 
 
 
116 aa  127  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  52.63 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  49.12 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  55.36 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  52.21 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  50.89 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  55.36 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  50 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  53.51 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  51.75 
 
 
115 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  55.26 
 
 
119 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  47.37 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  53.57 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  48.31 
 
 
116 aa  123  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  52.68 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  51.26 
 
 
116 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  51.75 
 
 
115 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  53.57 
 
 
115 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  51.26 
 
 
116 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  51.79 
 
 
115 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  51.79 
 
 
118 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  51.79 
 
 
118 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  48.7 
 
 
114 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  50 
 
 
124 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  53.64 
 
 
119 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  47.37 
 
 
113 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  50.89 
 
 
115 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  50.89 
 
 
116 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  52.68 
 
 
116 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  47.86 
 
 
116 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  53.51 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  49.11 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  51.35 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  48.21 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  45.13 
 
 
118 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  49.11 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  52.25 
 
 
118 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  49.56 
 
 
117 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  50 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  45.69 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  48.18 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  114  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  45.22 
 
 
114 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  45.22 
 
 
113 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  51.82 
 
 
126 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  46.09 
 
 
114 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  46.55 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  41.38 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  43.1 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  45.3 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  42.02 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  49.09 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  46.55 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  43.86 
 
 
121 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  45.3 
 
 
152 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  47.83 
 
 
115 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  50.93 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  42.61 
 
 
120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  47.71 
 
 
114 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  44.44 
 
 
152 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  43.86 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  46.79 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  46.3 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  40.52 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  40 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  44.35 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  44.35 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  46.79 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>